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「ESMO 2021」世和篇章IV:多癌种早筛研究队列成果显现良好应用前景

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*仅供医学专业人士阅读参考

欧洲肿瘤内科学会年会(ESMO大会)是欧洲最负盛名和最具影响力的肿瘤学会议,坚持以多学科多维度促进癌症的治疗和推进肿瘤医学专业的发展,现已成为集临床实践、转化研究及多学科交叉讨论为一体的全球性学术交流平台。受全球疫情影响,今年将以虚拟会议形式于2021年9月16-21日举行。

世和基因连续7年参与AACR、ASCO、ESMO和WCLC等国际大型会议,迄今已中稿100多项研究成果。本届ESMO大会,世和基因参与的多项研究成果在会议中通过Poster形式展出。这些研究成果将分为4个篇章陆续为大家分享。


篇章I:ctDNA MRD新评估方法展示巨大应用潜力

篇章II:多样性体液样本ctDNA液体活检意义凸显

篇章III:NGS助力肿瘤精准医学全方位应用

篇章IV:多癌种早筛研究队列成果显现良好应用前景。

2021 ESMO 世和基因研究成果展示 篇章IV

肿瘤的早期发现和早期治疗与预后密切相关,但现有的肿瘤早筛手段尚存在多种局限性,特别是在敏感性、特异性以及无创性上均存在一定的不足,因此临床亟需一种灵敏度更高的无创早筛方法。近年来随着NGS技术的发展,液体活检在肿瘤早筛中显现出良好的应用前景。

世和基因与复旦大学附属中山医院、复旦大学附属肿瘤医院等多家医院合作,利用自主研发的MERCURY多组学液体活检早筛技术,建立了肝癌、肠癌等多个癌种的早筛研究队列。肝癌、肠癌相关研究成果将在2021年ESMO会议上以Poster形式展出。

Poster摘要号:2507

Integrating Fragmentomic Features for Non-Invasive Early Detection of Colorectal Advanced Adenoma and Adenocarcinoma

研究团队:复旦大学附属肿瘤医院蔡三军教授、彭俊杰教授团队
成果亮点:循环游离DNA(cfDNA)片段组学液体活检技术为进展期腺瘤和早期结直肠癌提供了一种全新的经济高效早筛手段。

结直肠癌是我国发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一,早期(0/Ⅰ期)肠癌5年生存率高达90%以上,而晚期(Ⅳ期)患者5年生存率仅为5%-7%,早期筛查能有效降低肠癌死亡率。结肠镜检查是早期发现结直肠癌和癌前病变的金标准,然而由于创伤性等因素患者的依从性较差。

 
粪便潜血试验(FOBT)等无创筛查方法又存在灵敏度不足的问题。复旦大学附属肿瘤医院蔡三军教授、彭俊杰教授团队开展了DECIPHER-Colon(Detecting Early Cancer by Inspecting ctDNA Features)研究,旨在基于液体活检技术构建一种新型的结直肠癌早筛方法,用以准确经济高效无创的筛查早期结直肠癌和进展期腺瘤。

本研究共纳入390例早期结直肠癌患者和进展期腺瘤患者,分别采集受试者血浆cfDNA样本进行全基因组低深度测序,并1:1分为训练队列和验证队列。在训练队列中,基于五种机器学习模型和五种cfDNA片段组学特征构建了区分健康人和进展期腺瘤/早期肠癌的多组学肠癌早筛模型,并在验证队列中进行独立验证。

 
本研究中构建的多组学早期结直肠癌筛查模型,区分健康人和进展期腺瘤/早期肠癌的AUC为 0.988,在94.8%的特异性下,进展期肠腺瘤和早期肠癌的敏感性分别达到95.7%和98.0%。即使在FOBT阴性或CEA阴性的早期肠癌中,本早筛模型检测敏感性也达到 100% 和 97.6%。进一步亚组分析显示,该早筛模型在不同级别的进展期腺瘤和有蒂/无蒂腺瘤中均表现出较高的敏感性。
 
此外,本研究构建的肠癌早筛模型在1X测序深度下也表现出优异的性能,展现较好的经济实用性。
结论:DECIPHER-Colon研究基于五种cfDNA片段组学特征构建的多组学结直肠癌早筛模型,在进展期腺瘤和早期肠癌筛查中均展现出超高的灵敏度和特异性,为非侵入性结直肠癌临床筛查提供了一种全新的经济高效的检测方法。

Poster摘要号:2546

Ultra-Sensitive and Cost-effective Method for Early Stage Hepatocellular Carcinoma and Intrahepatic Cholangiocarcinoma Detection Using Plasma cfDNA Fragmentomic Profiles

研究团队:复旦大学附属中山医院周俭教授、王征教授团队

成果亮点:基于血浆cfDNA片段特征构建了一种预测性能优异、成本经济实用的非侵入性原发性肝癌筛查方法,并首次报道cfDNA片段特征在区分肝细胞癌和肝内胆管癌上展现出良好的应用潜能。

原发性肝癌(PLC)是全球癌症死亡的主要原因,也是慢性肝病患者最常见的死亡原因,居我国癌症死因的第二位。原发性肝癌包括肝细胞癌(HCC)、肝内胆管癌(ICC)和混合型肝癌(cHCC-ICC)三种类型,其中HCC占所有肝癌的80%以上。

以往肝癌早筛研究主要集中于HCC,对ICC以及cHCC-ICC关注较少。复旦大学附属中山医院周俭教授和王征教授团队开展了DECIPHER-Liver(Detecting Early Cancer by Inspecting ctDNA Features)研究,旨在开发一种基于cfDNA低深度全基因组测序、经济高效的原发性肝癌早筛方法,并对cfDNA片段特征用于区分HCC和ICC的潜能进行初步的探究。

本研究共纳入381例原发性肝癌患者,采集受试者血浆,并1:1分为训练队列和验证队列。在训练队列中基于cfDNA片段大小特征,利用机器学习的方法构建了一种新的原发性肝癌早期筛查模型,并在验证队列中对模型性能进行了独立验证。

该模型在验证队列中展现出优秀的预测性能,AUC达到0.995,98.8%特异性下敏感性达到96.8%。亚组分析显示,该筛查模型在早期PLC、小肝癌、HCC和ICC中均表现出良好的敏感性。另外该模型在区分PLC与肝硬化和/或HBV阳性受试者方面同样展现出优异的预测性能。

不仅如此,该早筛模型在测序深度不断降低的过程中表现出稳定的预测性能,即使在1X 超低测序深度下AUC仍为0.994。最后,本研究还发现,运用HCC和ICC片段组学特征单独构建的模型,在区分HCC和ICC方面也显示出巨大的应用潜力。

结论:DECIPHER-Liver 研究基于全基因组低深度测序,通过cfDNA片段特征构建了一种新的原发性肝癌早筛模型,预测性能较以往报道更佳,且在非常低的测序深度下仍保持较好的预测敏感性,为原发性肝癌无创临床筛查提供了一种新的经济高效的检测手段,同时该方法在区分HCC和ICC不同病理亚型上也展现出较好的应用潜能。

致力于肿瘤精准分子检测及临床研究,为医院提供一站式NGS解决方案,荣膺 “2021中国独角兽企业”殊荣。

NGS及液体活检实验室获CAP/CLIA/ISO15189三重国际认证,174次满分通过国家卫健委临检中心室间质评。

已服务临床超8年,检测肿瘤样本超50万例,液体活检超25万例。

累计合作发表SCI论文290篇,总IF超2200分,获批30余项专利。

EGFR/ALK/ROS1/BRAF/KRAS/HER2基因突变检测试剂盒(国械注准20183400408)于2018年9月作为首批NGS IVD产品获批上市。

425基因TMB试剂盒是中国首个且唯一进入NMPA创新医疗器械特别审批通道的大Panel试剂盒。

2020年9月启动基于MERCURY多组学液体活检技术的1.5万例前瞻性泛癌种早筛临床研究—金陵队列。

2021年5月发表国内首个前瞻性多中心早期肠癌ctDNA MRD大型研究成果。

*此文仅用于向医学人士提供科学信息,不代表本平台观点

 

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