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组织样本还是血液样本,您选对了么?

对于非小细胞肺癌患者而言,一般都要进行基因检测,寻找驱动基因突变,以挑选合适的靶向药使用。基因检测使用的样本常来源于肿瘤组织,采用血液样本进行的液体活检也被大家所熟知。这两种基因检测,有哪些不同,该怎么选呢?

图1. 肺癌基因检测结果可用于诊断和用药参考。来源1

组织基因检测

组织基因检测,是指直接对肿瘤组织里的癌细胞DNA进行测序,目前这仍是基因突变检测的金标准。

不过,组织基因检测并非对每个患者都适用,有的肿瘤没法取出足够的组织进行测序。此外,肿瘤细胞的异质性高,进化快,不同细胞携带的突变可能不一样,对肿瘤的不同部位进行取样,往往会得到不同的结果,影响后续的结果解读和用药选择。

血液液体活检

血液基因检测,又称液体活检,是指对血液中的来源于实体肿瘤的DNA片段进行测序,找基因突变。为什么血液里能检测出肺等其他器官中肿瘤的DNA呢?这是因为虽然实体肿瘤是长在某个器官中,但仍通过血管和血液系统有着密切的联系。当肿瘤细胞的DNA脱落时,或者肿瘤细胞死亡后,DNA会进入血液循环系统,如果能捕获到这些肿瘤细胞DNA片段,就能进行基因测序,间接知晓肿瘤的基因突变状况。

液体活检不会受到肿瘤异质性的影响,但是需要在大量的正常细胞DNA中,检测出微量的肿瘤细胞DNA,对技术的灵敏度有极高要求。相比起组织检测,液体活检的价格还比较昂贵。

两种检测方式相辅相成

最近,来自新加坡的研究人员对分别使用这两种检测方法的非小细胞肺癌患者进行了比较2

研究招募了71名疑似肺癌患者,收集了组织和血液样本,两种样本的采集时间差不超过两天,这是因为如果相隔时间太久,肿瘤可能发生了变化,这样两种技术的结果就没有什么可比性了。

对于通过组织学或细胞学诊断为非小细胞肺癌的病例,使用组织样本进行EGFR基因突变的检测,然后和液体活检的结果进行比较。

•样本取样难度

对于确诊的54例非小细胞肺癌,由于样本不足,只有70.3%(38/54)的病例能进行组织样本EGFR基因检测。血液比起组织来就好取样多了,98.1%(53/54)的病例都有血液样本。

•测出EGFR突变的比例

38例组织样本中,有31.6%(12/38)发现了EGFR经典突变(21外显子L858R突变或19外显子缺失突变),能够使用靶向药。

53例血液样本中,有37.7%(20/53)发现了EGFR经典突变,其中包括两个没有组织EGFR结果的病例,以及KRAS, BRAF和MET等基因突变。也就是说,这些患者即使没有足够的组织样本进行基因测序,通过血液基因检测仍能发现EGFR等基因上的敏感突变,指导临床用药。

•血液检测的灵敏度和特异性

同时有组织和血液检测结果的患者有37例。在这些患者中,血液检测EGFR突变的灵敏度为75%(9/12),也就是说,组织检测发现12例病例有EGFR突变,其中9例能通过血液检测到。特异性为100%(25/25),也就是说,组织检测发现25例病例没有EGFR突变,通过血液也没有发现EGFR突变。

•检测时间

在这项研究中,从血液液体活检到诊断的过程平均需要10天。组织检测的周转时间更长,平均长达29.9天。

在这个患者队列中,组织EGFR检测为22.2%(12/54)的患者提供了临床用药参考;如果加上血液检测,检出EGFR和其他基因敏感突变的患者比例增加到了42.6%(23/54),为更多的患者提供了临床用药参考。

启示

对于依赖于基因检测选择靶向药物的非小细胞肺癌患者而言,组织检测和血液检测都各有其优缺点。用肿瘤组织进行基因检测仍是金标准,不过有时候基于血液的液体活检能起到重要的辅助作用,特别是在组织基因检测没法做的时候,提供宝贵的信息和用药参考。

有条件的患者,可以两种都考虑。我们也期望各种基因测序的成本能尽快降下来,为更多的患者提供更准确的诊断和用药参考!

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